|
عنوان
|
استنباط روابط علی بین ژنهای هاب ترانسکریپتومی و بافت پستانی گاوهای شیری با مدل سازی معادلات ساختاری
|
|
نوع پژوهش
|
مقاله ارائه شده کنفرانسی
|
|
کلیدواژه‌ها
|
بار عاملی، ریزآرایه DNA، ژنهای هاب، متغیر پنهان
|
|
چکیده
|
هدف از این پژوهش، استخراج روابط علی- معلولی بین ژنهای هاب ترانسکریپتومی و بافت پستانی در داده های بیان ژنی ریزآرایه DNA با استفاده از مدل سازی معادلات ساختاری بود. بدین منظور داده ریزآرایه با شماره دسترسی GSE24560 از پایگاه اطلاعاتی GEO استخراج شد. مدل سازی معادلات ساختاری و استخراج روابط علی-معلولی بین ژنهای هاب در بافت پستانی با استفاده از Amosنسخه 24انجام گرفت. ژنهای هاب و بافت پستانی بهترتیب به عنوان متغیرهای آشکار و پنهان استفاده شدند. نتایج حاصل از این پژوهش نشان داد که تمامی 4ژن هاب ترانسکریپتومی به غیر از LOC616942 دارای بارهای عاملی در ارتباط با متغیر پنهان (بافت پستان) بودند. درنهایت توصیه میشود در مدل سازی روابط ژنی به روش معادلات ساختاری، متغیرهای پنهان و آشکار (صفات و SNPها و مسیرهای متابولیکی) بیشتری مورداستفاده قرار گیرد.
|
|
پژوهشگران
|
امیر رشیدی (نفر دوم)، محمد رزم کبیر (نفر پنجم)، پرهام مرادی دولت آبادی (نفر چهارم)، امین مرتضوی (نفر اول)، مصطفی قادری زفره ای (نفر سوم)
|