عنوان
|
شناسایی بیوانفورماتیکی ژن های هدف چند میکروRNA جدید در انگور
|
نوع پژوهش
|
مقاله ارائه شده کنفرانسی
|
کلیدواژهها
|
انگور، روش های بیوانفورماتیکی، میکروRNA، ژن هدف، psRNATarget.
|
چکیده
|
میکرو RNA ها کلاسی از RNA های کوچک 24-20 نوکلئوتیدی درونزاد هستند که نقش های مهمی را در تنظیم پس از ترجمه ژن از طریق هدف قرار دادن mRNA ها برای برش یا سرکوب ترجمه ایفا می کنند. تمام پیش سازهای miRNAs دارای ساختارهای ثانویه حفظ شده مشابهی هستند که به کمک آن و با استفاده از روش های محاسباتی، وجود اورتولوگ ها یا همولوگ های میکروRNA های جدید را در دیگر گونه های گیاهی می توان پیش بینی کرد. بر این اساس و پس از رعایت مجموعه ای از ضوابط، تعداد 25 میکروRNA جدید متعلق به 3 خانواده mir-845 ، mir-5523و mir-171 در انگور شناسایی شد. به منظور درک نقش miRNAs جدید در شبکه های تنظیم ژن در انگور، تعداد 27 ژن هدف برای این 3 خانواده miRNAs با استفاده از پایگاه اطلاعاتی psRNATarget شناسایی شد که بیانگر عملکرد آنها در پروسه های مختلف بیولوژیکی از جمله متابولیسم، نمو، کنترل تقسیم سلولی، مورفوژنز و انتقال سیگنال است. این داده ها اطلاعات مفیدی را پیرامون توصیف عملکرد miRNAs در انگور فراهم آورد
|
پژوهشگران
|
جلال رستم زاده (نفر سوم)، سهیلا فاطمی (نفر اول)، بهمن بهرام نژاد (نفر دوم)
|