عنوان
|
همسانه سازی و مطالعه ژن های شبه سایکلوتاید در گندم
|
نوع پژوهش
|
پایان نامه
|
کلیدواژهها
|
گره سیستئینی،خانواده ژنی،پپتیدهای حلقوی ضد میکروبی،RACE-PCR '3، بیان ژن شبه سایکلوتاید.
|
چکیده
|
سایکلوتایدهادسته ایاز پروتئین های کوچک غنی از سیستئین می باشند و این پپتیدها حدود 30 اسیدآمینه دارند. در آن ها یک ساختار منحصربه فردبه وسیله سه باند دی سولفید، به نام گره سیستئینی ایجاد می شود. سایکلوتایدها خانواده بزرگی ازپپتیدهایحلقویضدمیکروبیهستندکهفعالیت-هایزیستیمتنوعیدارندکه ازجملهمی توانبهفعالیتضدمیکروبی،ضدتوموری،ضدویروسی،از بین بردن گلبول های قرمز،سلول کشی و حشره کشیاشارهنمود. شبه سایکلوتاید ها در گیاهان به صورت خانواده ژنی بیان می شوند. این ژن ها دارای نواحی حفاظت شده ای می باشند که در این پژوهش بر اساس توالی نواحی حفاظت شده آغازگر طراحی شدو با استفاده از تکنیکRACE-PCR'3 ژن هایکدکننده پروتئین های شبه سایکلوتاید در گندم همسانه سازی و تعیین توالی شدند. مقایسه توالی های به-دست آمده با توالی موجود در پایگاه داده ای PGI نشان داد تعداد 11 توالی نوکلئوتیدی شبه سایکلوتاید از گندمبه دست آمده است. توالی های نوکلئوتیدی به دو دسته تقسیم شدند و توالی پروتئینی آن هانیز به دو دسته تقسیم شدند. توالیTacycl2 در یک دسته و بقیه توالی ها در دسته دیگر قرار گرفتند. این توالی ها شباهت زیادی با توالی های شبه سایکلوتاید احتمالی در خانواده گرامینه دارند. تعداد نوکلئوتیدهای این توالی ها 402-479 متغیر بود. بیان نیمه کمی یکی از ژن-هایشبه سایکلوتاید در اندام های ریشه، کلئوپتیل، ساقه، برگ و گل آذین مطالعه شد. کلئوپتیل بیشترین میزان بیان نسبی و ساقه کمترین میزان بیان نسبی را نشان داد. همچنین بیان ژن شبه سایکلوتایددر اندام برگ با تیمار اسید سالیسیلیک مطالعه شد اما نتایج به دستآمده نیاز به مطالعات کمی داشت. این اولین مطالعه در زمینه همسانه سازیژن های شبه سایکلوتاید در خانواده گرامینهبود و نشان داد که در گندم ژن های شبه سایکلوتاید وجود دارد.
|
پژوهشگران
|
جلال رستم زاده (استاد مشاور)، بهمن بهرام نژاد (استاد راهنما)، سمیرا ترکمن (دانشجو)
|