به منظور تهیه DNA بارکد ماهیان استان کردستان طی سال های 1390 الی 1392 از پنج حوزه و زیر حوزه های آبریز مربوطه در استان کردستان اقدام به صید و جمع آوری نمونه گردید. در این نمونه برداری تعداد 1682 قطعه ماهی صید گردید. بر اساس نتایج مطالعات ماهی شناسی تعداد 51 گونه ماهی متعلق به 28 جنس، هشت خانواده چهار راسته، از رده ماهیان استخوانی در منابع آبی استان کردستان با توجه به خصوصیات ریخت شناسی، شناسایی گردید. از 51 گونه شناسایی شده سه گونه Oxynoemacheilus chomanicus، Oxynoemacheilus kurdistanicus، Oxynoemacheilus zagrosensis ، گونه های جدید در دانش ماهی شناسی بوده که برای اولین بار در مطالعه حاضر شناسایی و گزارش شده است. الگوی پراکنش گونه های ماهی در حوزه های آبریز استان متفاوت بوده و در هر حوزه آبریز بعلت فعالیت های انسانی تعدادی گونه های غیر بومی وارد شده است. از هر گونه ماهی بومی شناسایی شده بر اساس خصوصیات ماهی شناسی، توالی زیر واحد یک ژن سیتوکروم اکسیداز (COI) به تعداد سه نمونه از هر گونه تهیه و برای تعیین DNA بارکد ماهیان استان کردستان مورد استفاده قرار گرفت. اطلاعات بدست آمده برای هر گونه ماهی در تهیه دندروگرام های هشت خانواده ماهیان موجود در استان مورد استفاده قرار گرفت. با توجه به عدم وجود بارکد اغلب گونه های شناسایی شده استان در پایگاه بارکدینگ ماهیان، تعلق هر یک از گونه های ماهی شناسایی شده به تاکسون جنس مربوطه مورد بررسی قرار گرفت. نتایج بارکدینگ ماهیان استان، نشان دهنده تایید نتایج شناسایی گونه ها بر اساس خصوصیات ریخت شناسی آنها است.