عنوان
|
بررسی پلیمورفیسم ژنهای PIWIL1 (rs10773771)، PIWIL4 (rs508485) و piR-021285 (rs1326306) در مبتلایان به سرطان سینه در کردستان-عراق
|
نوع پژوهش
|
پایان نامه
|
کلیدواژهها
|
سرطان سینه، PIWIL1، PIWIL2، piRNA-021285، اقلیم کردستان عراق
|
چکیده
|
سرطان سینه شایع ترین سرطان در میان زنان است. سرطان سینه یک بیماری چندوجهی است که توسط ترکیبی از عوامل ارثی و محیطی تحت تاثیر قرارگرفته و منجر به تجمع تدریجی تغییرات ژنتیکی و اپی ژنتیکی در سلول های سرطان سینه میشود. سرطان سینه یا 3/38% شایعترین نوع سرطان در میان زنان کشور عراق شناخته میشود که به طور قابل توجهی از شیوع جهانی سرطان سینه در زنان با 5/24% بیشتر است. با توجه به اهمیت بالای این بیماری، مطالعه حاضر با هدف بررسی ارتباط سه پلیمورفیسم شامل PIWIL1 rs10773771، PIWIL4 rs508485 و piRNA-021285 rs1326306 با سرطان سینه در زنان اقلیم کردستان عراق انجام شد. در مجموع 100 نمونه خون از زنان مبتلا به سرطان سینه جمعآوری شد. همچنین 100 نمونه خون از افراد سالم به عنوان گروه کنترل جمعآوری گردید. برای استخراج DNA ژنومی از نمونههای خون از روش Salting-out استفاده شد. جهت شناسایی پلیمورفیسمهای تک نوکلئوتیدی (SNPs)، از روشهای PCR-RFLP، Tetra ARMS و ARMS استفاده شد. دادههای بهدستآمده با استفاده از رگرسیون لجستیک تحت چهار مدل وراثتی شامل co-dominant، dominant، recessive و over-dominant با استفاده از نرمافزار SNPstats مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. علاوه بر این، محاسبه فراوانی آللی و ژنوتیپی، آزمون تعادل هاردی واینبرگ، عدم تعادل لینکاژ و آنالیز ارتباط هاپلوتیپی نیز انجام گرفت. نتایج مطالعه حاضر نشان داد که هیچ ارتباط معنیداری بین PIWIL1 rs10773771، PIWIL4 rs508485 وpiRNA-021285 rs1326306 و سرطان سینه در زنان ساکن در اقلیم کردستان عراق وجود ندارد. آنالیز PCR-RFLP برای piRNA-021285 سه ژنوتیپ را شناسایی کرد و نشان داد که ژنوتیپ A/C بیشترین فراوانی را در مقایسه با دو ژنوتیپ دیگر دارد. علاوه بر این، PCR-RFLP در ترکیب با تجزیه و تحلیل ARMS سه ژنوتیپ را برای PIWIL1 rs10773771 شناسایی کرد که فراوانی ژنوتیپ T/T بالاتر از ژنوتیپهای T/C و C/C بود. برخلاف این ژنها، Tetra ARMS تنها دو ژنوتیپ را برای PIWIL4 rs508485 شناسایی کرد که شامل ژنوتیپهای C/C و C/T میشد. آزمون تعادل هاردی واینبرگ برای piRNA-021285 هیچ انحراف معنیداری از تعادل نشان نداد (p > 0.05). با این حال، هنگامی که ژنهای PIWIL1 و PIWIL4 مورد آنالیز قرار گرفت، انحراف مجموع نمونههای دارای سرطان سینه و گروه کنترل معنیدار بود. آنالیز تعادل لینکاژی برای ژنهای مورد مطالعه بر اساس SNPهای شناساییشده، همبستگی معنیداری را بین piRNA-021285 و PIWIL4 و همچنین ژنهای PIWIL4 و PIWIL1 نشان داد. آنالیز ارتباط هاپلوتیپی هیچ ارتباط معنیداری بین سرطان سینه و هاپلوتیپهای مورد مطالعه نشان نداد. با این وجود، اثر هاپلوتیپ C-T-T بر سرطان سینه که بترتیب آللهای ژنهای piRNA-021285-PIWIL4-PIWIL1 بودند در مقایسه با هاپلوتیپ مرجع (A-T-T) با OR=114672774331.05 بسیار معنیدار بود.
|
پژوهشگران
|
جلال رستم زاده (استاد راهنما)، دانیا آزاد حمه توفیق (دانشجو)
|