عنوان
|
بررسی ساختار خانواده ژنی FAD (fatty acid desaturase)، مربوط به عطر و طعم در گیاه توت فرنگی وحشی دیپلوئید Fragaria vesca به صورت بیوانفورماتیکی
|
نوع پژوهش
|
مقاله ارائه شده کنفرانسی
|
کلیدواژهها
|
توت فرنگی وحشی، عطر و طعم ، ژن FAD
|
چکیده
|
آنزیم های FAD بعنوان مسئول عطر و طعم در میوه توت فرنگی شناسایی شده اند. در این مطالعه تعداد 25 توالی پروتئینی پیش بینی شده بعنوان FAD با جستجو در پایگاه داده تشخیص داده شد. همگی توالی های مورد بررسی دارای دامنه پروتئینی FAD بودند. ژن های مربوط به توالی های پروتئینی بدست آمده روی هر همه کروموزوم های توت فرنگی وحشی بغیر از کروموزوم شماره 5 پراکنش داشتند و تعداد نواحی اینترون در آنها بین 0 تا 8 عدد مشاهده شد. مطالعات فیلوژنی حاکی از آن بود که توالی های مورد بررسی در 5 گروه مختلف قرار گرفتند که هر گروه مربوط به یکی از کلاس های خانواده FAD بود. نتایج بررسی ساختار ژنی و ترکیب موتیف ها نشان دهنده حفظ شدگی بالا در هر گروه از خانواده FAD در چینش و پراکندگی موتیف ها بود. اغلب موتیف های مورد برسسی دارای ویژگی های خانواده FAD از جمله وجود جعبه های هیستیدینی بودند. بررسی نواحی تنظیمی مربوط به ژن های گروه Omega 6 FAD بعنوان ژن های دخیل در عطر و رایحه میوه توت فرنگی نشان دهنده القاپذیری این ژن ها تحت تاثیر محرک های محیطی مختلف بویژه نور بود. بررسی خانواده های ژنی در خویشاوندان وحشی گیاهان اهلی پلی پلوئید می تواند باعث بدست آمدن چهارچوبی مناسب جهت طراحی برنامه های اصلاحی برای گیاهان اهلی باشد لذا ما در این مطالعه خانواده ژنی FAD در گیاه وحشی دیپلوئید Fragaria vesca مورد بررسی قرار دادیم.
|
پژوهشگران
|
عرفان شاه منصوری (نفر چهارم)، ندا زندی نوا (نفر سوم)، بهمن بهرام نژاد (نفر دوم)، هیمن صالحی (نفر اول)
|