مشخصات پژوهش

عنوان	مقایسه روش های آماری مختلف در پیش بینی ژنومی بر اساس معیار اثربخشی انتخاب
نوع پژوهش	مقاله ارائه شده کنفرانسی
کلیدواژه‌ها	اثربخشی انتخاب، انتخاب ژنومی، فاصله نسل، رتبه بندی دام
چکیده	هدف از این مطالعه بررسی روش های آماری مختلف بر اساس معیار اثربخشی انتخاب در 4 سناریوی متفاوت شامل: یک. وراثت پذیری 0.5 و تعداد 50 QTL، دو. وراثت پذیری 0.5 و تعداد 500 QTL، سه. وراثت پذیری 0.1 و تعداد 50 QTL و چهار. وراثت پذیری 0.1 و تعداد 500 QTL بود. در این راستا ژنومی حاوی 10 کروموزوم هرکدام به طول 100 سانتی مورگان با تراکم نشانگری 5000 برای هر کروموزوم شبیه سازی شد. در این مطالعه جمعیت پایه ای با اندازه 1000 حیوان با نسبت جنسی برابر شبیه سازی شد و این ساختار جمعیتی طی 1000 نسل به طور ثابت باقی ماند، سپس تا نسل 1005 به صورت تدریجی به 500 حیوان کاهش و از نسل 1005 تا 1010 به 2000 حیوان افزایش یافت (تمامی آمیزش ها به صورت تصادفی در نظر گرفته شد). در مرحله بعد 5 نسل براساس آخرین نسل جمعیت پایه شبیه سازی شد که حیوانات 2 نسل اول به عنوان گروه مرجع و 3 نسل بعدی جمعیت تایید را تشکیل دادند. به منظور پیش بینی ارزش های اصلاحی افراد جمعیت مرجع و تایید از سه روش بهترین پیش بینی نااریب خطی ژنومیک، بیز A و بیز B استفاده گردید. با افزایش تعدادQTL از 50 به 500، میزان SE در تمامی سناریو ها کاهش یافت. در تعداد پایین QTL بیز B عملکرد بهتری نسبت به سایر روش ها داشت، اما با افزایش تعداد QTL، روش GBLUP عملکرد بهتری نسبت به روش های بیزی از خود نشان داد. با افزایش فاصله نسل بین جمعیت مرجع و جمعیت تأیید، میزان SE به شدت کاهش یافت اما تفاوت قابل توجهی در میزان کاهش SE بین مدل های مختلف مشاهده نشد.
پژوهشگران	امیر رشیدی (نفر چهارم)، رستم عبداللهی آرپناهی (نفر سوم)، محمد رزم کبیر (نفر دوم)، مجتبی تمدنی آرانی (نفر اول)