عنوان
|
شناسایی گونه های Colletotrichum دخیل در بیماری آنتراکنوز توت فرنگی در استان کردستان بر اساس ویژگی های ریخت شناسی و مولکولی و کنترل زیستی این بیماری با استفاده از آنتاگونیست های قارچی و باکتریایی
|
نوع پژوهش
|
پایان نامه
|
کلیدواژهها
|
توت فرنگی، آنتراکنوز، Colletotrichum spp، شناسایی چند منظری، کنترل زیستی، Trichoderma spp، Pseudomonas spp
|
چکیده
|
بیماری آنتراکنوز توت فرنگی که توسط گونه های جنس Colletotrichum ایجاد می شود، یکی از عوامل محدود کننده اصلی کشت توت فرنگی در سرتاسر جهان به شمار می رود. این بیماری اخیراً در مناطق عمده کشت توت فرنگی در ایران بصورت همه گیری ظهور پیدا کرده است. از این رو، در این مطالعه شناسایی گونه-های Colletotrichum ایجادکننده آنتراکنوز توت فرنگی و کارآیی آنتاگونیست های قارچی و باکتریایی جهت کنترل این بیماری مورد بررسی قرار گرفت. به منظور شناسایی، ترکیبی از داده های ریخت شناختی، مولکولی و تعامل میزبان - بیمارگر (اشاره به مفهوم تلفیقی گونه) برای تشخیص گونه های ایجادکننده بیماری آنتراکنوز توت فرنگی در استان کردستان بکار برده شد. در آنالیز تبارشناختی چند ژنی با توجه به نوع گروه -های قارچی مورد مطالعه و با استفاده از چهار ناحیه ژنی ITS-rDNA ،LSU-rDNA، beta-tubulin (TUB2) و glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH)، هویت اکثر جدایه ها (95 جدایه) گونه Colletotrichum nymphaeae و تعداد 18 جدایه نیز گونه Pilidium lythri تعیین گردید. هیچ تنوع درون گونه ای معنی داری از لحاظ خصوصیات ریخت شناختی و بیماری زایی میان جدایه-های مورد بررسی مشاهده نشد. با استفاده از نشانگرهای چند شکلی توالی های تکرار شونده ساده بینابینی (ISSR) و توالی های تکراری (rep-PCR) برای جدایه های C. nymphaeae و نشانگرهای چند شکلی قطعات تکثیر شده تصادفی (RAPD) و ماهوارک (M13 minisatellite) برای جدایه های P. lythri، هیچ تنوع ژنتیکی میان جدایه های مورد بررسی مشاهده نشد. طبق نتایج این مطالعه می توان ادعا کرد که جمعیت-های این دو گونه از طریق اثر بنیان گذار از یک منبع خاص نشأت گرفته اند. آنالیز زمان سنجی مولکولی برای گونه C. nymphaeae براساس ساعت زمان سنجی آرام، واگرایی هم زمان زیر خوشه S5 C. nymphaeae و گیاه توت فرنگی را نشان داد. نتایج این آنالیز وجود ارتباط بسیار نزدیک و تکامل همسو میزبان و بیمارگر را اثبات کرد. در این مطالعه همچنین کارآیی 20 جدایه محلی جنس Trichoderma بدست آمده از ریزوسفر و فیلوسفر گیاه توت فرنگی و سه استرین تجاری T. atroviride SC1، Pseudomonas chlororaphis M17 وP. protegens Pf-5 در مقابل استرین بیمارگر C. nymphaeae CCh32 در شرایط in vitro وon planta مورد ارزیابی قرار گرفت. در ابتدا، آنالیز تبارشناختی جدایه
|
پژوهشگران
|
ایلاریا پرتوت (استاد مشاور)، جهانشیر امینی (استاد مشاور)، مهدی ارزانلو (استاد راهنما)، اسدالله بابای اهری (استاد راهنما)، کیوان کریمی (دانشجو)
|