مشخصات پژوهش

عنوان	بررسی خصوصیات فنوتیپی و تنوع ژنتیکی جدایه های Ralstonia solanacearum عامل بیماری پژمردگی باکتریائی سیب زمینی جداشده از استان کردستان
نوع پژوهش	مقاله چاپ‌شده در مجلات علمی
کلیدواژه‌ها	پژمردگی باکتریائی سیب زمینی، تنوع ژنتیکی، فیلوتیپ، R. solanacearum
چکیده	ویژگی های فنوتیپی و تنوع ژنتیکی 24 جدایه باکتری Ralstonia solanacearum عامل بیماری پژمردگی باکتریائی سیب زمینی جدا شده از مناطق مختلف استان کردستان مورد بررسی قرار گرفت. براساس خصوصیات فیزیولوژیک و بیوشیمیائی، 19جدایه R. solanacearum بعنوان بیووار 2 تشخیص داده شدند. پنج جدایه، خصوصیات فنوتیپی بیووار 3 را دارا بودند. صحت تشخیص تمامی جدایه ها در سطح گونه توسط واکنش زنجیره ای پلیمراز و با استفاده از آغازگرهای 759/760 اختصاصی گونه مورد تایید قرار گرفت. در مطالعه جدایه ها با استفاده از روش (Pmx) Multiplex PCR، تمامی جدایه های تشخیص داده شده تحت عنوان بیووار 2 با تکثیر باندهائی با اندازه تقریبی 282 و 372 جفت باز در فیلوتیپ II قرار گرفتند. پنج جدایه با خصوصیات فنوتیپی شبیه به بیووار3، در واکنش Pmx باند اختصاصی گونه به اندازه تقریبی 282 جفت باز به اضافه باند با اندازه تقریبی 191 جفت باز تکثیر نمودند که اختصاصی هیچکدام از گروه های فیلوتیپی نمی باشد. نوع ژنتیکی جدایه ها به روش rep-PCR و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی REP، ERIC و BOX مورد بررسی قرار گرفت. آنالیز ترکیبی داده با استفاده از هرسه آغازگر به روش UPGMA و براساس ضریب تشابه دایس نشان داد که جدایه ها در سطح تشابه 43% به 5 گروه قابل تفکیک هستند. ارتباط مشخصی بین گروه بندی بدست آمده و منطقه جغرافیائی جدایه ها مشاهده نشد. نتایج حاصل از این تحقیق نشاندهنده تنوع ژنتیکی در جدایه های R. solanacearum جداسازی شده از استان مورد مطالعه می باشد.
پژوهشگران	بهروز حریقی (نفر دوم)، سحر پیره (نفر اول)