عنوان
|
مطالعه توالی های هسته ایی nrDNA ITS و طبقه بندی سیستماتیک گونه هایی از جنس Allium در ایران
|
نوع پژوهش
|
مقاله ارائه شده کنفرانسی
|
کلیدواژهها
|
آلیوم، آنالیز Bayesian، ITS، بیشینه صرفه جویی، تاکسونومی مولکولی
|
چکیده
|
جنس آلیوم احتمالاً بزرگترین جنس از تک لپه ایهاست که در حدود 850 گونه را شامل می شود. این جنس به صورت طبیعی در جنوب شرق و مرکز آسیا پراکنده شده است. گونه های جنس آلیوم که اخیراً برای ایران شناسایی شده اند به 7 زیر جنس و 29 بخش تعلق دارند. در این مطالعه توالی های نوکلئوتیدی ITS از داده های موجود در مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (NCBI) برای 21 گونه از آلیوم به دست آمد و از آنها برای استنتاج کردن ارتباطات درون گونه ایی توسط روشهای آنالیزی بیشینه صرفه جویی و Bayesian استفاده به عمل آمد. همترازی توالی های ITS برای 21 گونه آلیوم انجام شد. میانگین درصد واگرایی توالی ها در میان گونه های مورد مطالعه، 17.4% و بیشینه واگرایی ( بین A. oleraceum و A. noeanum) 34.41% بود. علاوه بر این 397 جایگاه متغیر و293 جایگاه حاوی اطلاعات در توالی های ITS وجود داشت، به ترتیب 60.51% و 44.66%. آنالیز سیستماتیک مولکولی توالی های ITS برای گونه های مورد مطالعه آشکار ساخت که گونه A. scabriscapum در زیر جنس Reticulatobulbosa ، با حمایت شاخه ایی بالا رابطه خویشاوندی نزدیکی با A. oleraceum در زیر جنس Allium دارد. گذشته از این، A. iranicum و A. sphaerocephalon که در بخش Allium طبقه بندی شده اند در شاخه ایی یکسان قرار نگرفته اند. طبقه بندی مابقی بخشها کاملاً با طبقه بندی جدید مطابقت دارد.
|
پژوهشگران
|
فاطمه حزباوی (نفر سوم)، محفوظ ادوای (نفر دوم)، شهلا حسینی (نفر اول)
|