مشخصات پژوهش

عنوان	بررسی ژن های دخیل در سنتز مونوترپن ها در گیاهان و ریزسازواره ها
نوع پژوهش	مقاله ارائه شده کنفرانسی
کلیدواژه‌ها	تیمول، مونوترپن، MEP، درخت فیلوژنی
چکیده	تیمول یک مونوترپن فنولی است که دارای 3 گروه متیل، یک حلقه بنزنی و یگ گروه هیدروکسیل با فرمول شیمیایی C10H14O می باشد. مونوترپن ها از مسیر MEP سنتز می شوند. در این مطالعه توالی های اسید آمینه ی مربوط به آنزیم های مسیر تولید مونوترپن ها از پایگاه اطلاعاتی NCBI دریافت شد و توالی هایی دیگر نیز از پایگاه اطلاعاتی phytozome با استفاده از بلاست توالی های ژن های DXS، DXR، MCT، CMK، MDS، HDS، HDR ، GDS، TPS، CYP مسیر تولید مونوترپن ها در آرابیدوپسیس علیه ژنوم گیاهان باقی مانده صورت گرفت. همردیفی توالی های پروتئین های بدست آمده با استفاده از نرم افزار ClustalW انجام شد، و در نهایت با استفاده از نرم افزار MEGA4 و با روش نزدیک ترین همسایگی و با بوت استرپ 100 رابطه فیلوژنی مربوط به توالی ها رسم شد. درخت فیلوژنی ژن DXS دخیل در مسیر بیوسنتزی مونوترپن در 27 گونه گیاهی و ریزسازواره ها رسم شده است، که این درخت فیلوژنی مربوط به 20 گونه گیاهی و 6 گونه باکتریایی و 1 گونه مخمر می باشد، که این گونه ها در هشت گروه مجزا قرار می گیرند که در آن توالی های مربوط به گیاهان در دو گروه قرار گرفته است و توالی های مربوط به باکتری ها در پنج گروه تقسیم بندی شده اند و مخمر Saccharomyces cerevisiae در گروه مجزا قرار گرفته شده است. برخی از گونه های گیاهی دارای چندین ایزوفرم از ژن می باشند.
پژوهشگران	عاطفه مشهدی ملک زاده (نفر اول)، محمد مجدی (نفر دوم)، اسعد معروفی (نفر سوم)