عنوان
|
مطالعه نظری انتخاب گزینی انانتیومری آنزیم کاندیدا آنتراکتیکا لیپاز B در واکنش های تبادل استری
|
نوع پژوهش
|
پایان نامه
|
کلیدواژهها
|
لیپاز B، تابعیت دانسیته، مدل کلاستر، انانتیومرگزینی، استری شدن
|
چکیده
|
انانتیومرگزینی آنزیم کاندیدا آنتراکتیکا لیپاز B برای واکنش استری شدن 1-فنیل اتانول و S-اتیل اکتانوات با استفاده از روش نظری تابعی چگالی الکترون مورد مطالعه قرار گرفت. این آنزیم واکنش انانتیومر R الکل با تیو استر را کاتالیز می کند و در واکنش انانتیومر S الکل تقریباً غیر فعّال است. روش کلاستر مکانیک کوانتومی برای مدل سازی واکنش مطالعه شده، استفاده شد. نتایج محاسبات نشان می دهد که آمینواسیدهای سه گانه کاتالیستی، توان جذب پروتون الکلی 1-فنیل اتانول را قبل از حمله هسته دوستی الکل به استر ندارند. نتایج نشان می دهند که واکنش انانتیومر R الکل با استر، یک واکنش مستقیم در درون جایگاه فعّال آنزیم می باشد. و این واکنش یک حمله-ی هسته دوستی اکسیژن الکل به کربن کربونیل استر است. همچنین، با حرکت الکل به سمت تیو استر، آمینواسیدهای سه گانه کاتالیستی به تدریج قدرت هسته دوستی اکسیژن الکلی 1-فنیل اتانول را افزایش می دهند. با این وجود، هیچ مسیری برای واکنش انانتیومر S به دست نیامد. دلیل این امر اختلاف الگوی پیوند های هیدروژنی انانتیومرهای الکل با آمینواسید سرین سه گانه کاتالیستی جایگاه فعّال است. فاصله ی پروتون الکلی در انانتیومر S از آمینواسیدهای سه گانه کاتالیستی خیلی زیاد است و هیچ پیوند هیدروژنی بین هیدروژن الکلی و آمینواسید Ser-105 وجود ندارد.
|
پژوهشگران
|
سعید حیدریان (دانشجو)، مهدی ایرانی (استاد راهنما)
|