عنوان
|
بررسی بیوانفورماتیکی ژن بتا آمیرین سینتاز در خانواده آستراسه و چندین خانواده گیاهی
|
نوع پژوهش
|
مقاله ارائه شده کنفرانسی
|
کلیدواژهها
|
بتا آمیرین، تری ترپن، Asteraceae، بیوانفورماتیک
|
چکیده
|
تری ترپنوییدها بزرگترین گروه از محصولات طبیعی گیاهی با بیش از بیست هزار عضو می باشند، که در صنعت داروسازی دارای اهمیت زیادی هستند. انواع اولئان (بتا آمیرین) ، اورسان (آلفا آمیرین) و داماران (دامارندیول) دارای بیشترین فراوانی در بین تری ترپن ها می باشند. بتا آمیرین با اسکلت اولئانی توسط آنزیم بتا آمیرین سینتاز با پیش ماده اکسیدو اسکوالن تولید می شود. ژن کد کننده این آنزیم در گونه های مختلف گیاهی از جمله در خانواده Asteraceae در دو جنس Aster و Artemisia توالی یابی شده است. در این تحقیق بررسی بیوانفورماتیکی ژن مزبور مورد بررسی قرار گرفته است. توالی های آمینواسیدی بتا آمیرین مربوط به چندین خانواده گیاهی از پایگاه اطلاعاتی NCBI دریافت شد و سپس همردیفی توالی ها با استفاده از نرم افزار clustalW صورت گرفت و درخت فیلوژنی رسم شد. نتایج نشان می دهد که ژن بتا آمیرین در خانواده Asteraceae رابطه فیلوژنی نزدیکتری با جنس Solanum از خانواده Solanaceae و جنس Gentiana از خانواده Gentiaceae دارد. سایز این پروتئین در بین گیاهان تحت بررسی در محدوده 779-750 اسید آمینه است و بیشترین وزن آن مربوط به گونه Betula platyphylla می باشد. نقطه ایزوالکتریک این پروتئین در محدوده 7-6 می باشد و بیشترین شاخص الیفاتیک که به عنوان یک عامل مثبت برای افزایش مقاومت حرارتی می باشد مربوط به گونه Gentiana straminea است.
|
پژوهشگران
|
اسعد معروفی (نفر دوم)، ژیلا حسین پناهی (نفر اول)
|