عنوان
|
همسانه سازی و بررسی ژن های شبه سایکلوتاید در ذرت
|
نوع پژوهش
|
مقاله چاپشده در مجلات علمی
|
کلیدواژهها
|
شبه سایکلوتاید، ذرت، پپتیدهای حلقوی ضد میکروبی،RACE-PCR '3
|
چکیده
|
سایکلوتایدهادسته ای بزرگ ازپپتیدهای حلقوی هستندکه فعالیت های زیستی متنوعی دارند.ازجمله می توان به فعالیت ضد میکروبی،ضدتوموری،ضدویروسی، تخریب گلبولهای قرمز، سلول کشی و حشره کشی اشاره کرد. شبه سایکلوتاید ها در گیاهان به صورت خانواده ژنی بیان شده و دارای نواحی حفاظت شده می باشند.در این پژوهش بر اساس توالی نواحی حفاظت شده پروتئین آغازگر طراحی شد و با استفاده از تکنیک RACE-PCR '3 ژن های کدکننده پروتئین های شبه سایکلوتاید در ذرت همسانه سازی و تعیین توالی شدند.مقایسه توالی های بدست آمده با توالی های موجود در پایگاه داده های ژنی PGIشان داد که تعداد نه ژن شبه سایکلوتاید جدید در ذرت به دست آمده است.مقایسه توالی نوکلئوتیدی و اسیدآمینه ای این ژن ها آنها را به دو دسته تقسیم کرد. دسته اول شباهت زیادی با سایر شبه سایکلوتاید های موجود در پایگاه داده های ژنی داشته و دارای نواحی حفاظت شده سایکلوتایدی بودند. دسته دوم دارای ساختار منظم سایکلوتایدی نبودند و تعداد نوکلئوتید های این دو دسته از 485-413 متغیر بود. این اولین گزارش در زمینه همسانه سازی ژن های شبه سایکلوتاید در گرامینه ها بود و نشان داد که ذرت تنوع بالایی از این ژن ها دارد.
|
پژوهشگران
|
نازنین کودری (نفر سوم)، سمیرا ترکمن (نفر اول)، بهمن بهرام نژاد (نفر دوم)
|