مشخصات پژوهش

عنوان	مطالعه مقایسه ای خصوصیات فنوتیپی و مولکولی باکتری مولد پوسیدگی نرم در استان های کردستان و آذربایجان غربی
نوع پژوهش	پایان نامه
کلیدواژه‌ها	باکتری، پوسیدگی نرم، Pectobacterium
چکیده	Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum ، Pectobacterium atrosepticum و Dickeya chrysanthemi از باکتری های پکتولیتیک می باشد که باعث بیماری پوسیدگی نرم و ساق سیاه در بسیاری از محصولات مهم تجاری در طول فصل رشد، حمل و نقل و انبار می شود. هر سه-ی این باکتری ها جز بیمارگر های فرصت طلب بوده که تمایل به ایجاد بیماری را در مواقعی که مقاومت گیاه میزبان شکسته شده باشد را دارند. 108 جدایه از غده و ساقه ی گیاهان میزبانی( سیب-زمینی، گوجه فرنگی، هویج و چغندرقند) که علائم بیماری را داشتند از مناطق مختلف استان کردستان و آذربایجان غربی جمع آوری گردید. خصوصیات فنوتیپی، بیوشیمیایی و انگشت نگاری DNA در مورد همه ی جدایه ها مورد مطالعه قرار گرفت. مطابق خصوصیات افتراقی فنوتیپی جدایه-ها Pectobacterium، Dickeya و جنس های حدواسط شناسایی شدند. بر اساس آنالیز های نتایج خصوصیات بیوشیمیایی و فنوتیپی جدایه ها به شش گروه تقسیم شدند. 31 جدایه نیز برای مطالعه خصوصیات ژنتیکی بر اساس توالی های تکرار شونده در واکنش زنجیره ایی پلیمراز انتخاب شدند. برای انگشت نگاری ژنتیکی از آغازگر های REP، ERIC و BOX استفاده شد. الگو های به دست آمده از REP-PCR بر اساس ضریب جاکارد تجزیه شدند و دندروگرام با استفاده از نرم افزار NTSYS ver 2/02 و روش UPGMA رسم گردید. آغازگر های REP، ERIC و BOX به ترتیب هشت، شانزده و پانزده گروه را تشخیص دادند. انگشت نگاری انجام شده توسط REP-PCR توانایی جدا کردن جدایه ها را حتی در سطح زیر گونه دارد در این مطالعه ERIC-PCR و BOX-PCR این توانایی را داشتند ولی به نظر می رسد که rep-PCR روش مناسبی جهت تفکیک باکتری ها در سطح زیر گونه نبوده است.
پژوهشگران	بهروز حریقی (استاد راهنما)، صغری حنانی (دانشجو)