نشانگر SCoT یکی از نشانگرهای جدید میباشد که براساس تنوع در ناحیه حفظ شده کدون آغاز ATG عمل میکند. در این مطالعه از 20 آغازگر مختلف برای برسی تنوع ژنتیکی 39 اکوتیپ سیاه دانه (Nigella sativa L) که عمدتاً از مناطق مختلف ایران جمع آوری شدند استفاده شد. کل باندهای تولید شده به وسیله این اغازگرها 118 عدد بود که 33 عدد (97/27%) چند شکل بودند.