|
عنوان
|
شناسایی نوروپپتیدها و گیرندههای نوروپپتیدی دخیل در تغذیه سن گندم با استفاده از توالییابی RNA
|
|
نوع پژوهش
|
پایان نامه
|
|
کلیدواژهها
|
ترانسکریپتوم، سن گندم، گیرندههای پروتئین جی، نوروپپتید
|
|
چکیده
|
سن گندم، Eurygaster integriceps Puton، یک آفت جهانی گندم است که سالانه خسارات اقتصادی قابل توجهی را وارد می کند. این مطالعه به حوزه ناشناخته نوروپپتیدها و گیرندههای جفتشده با پروتئین G (GPCRs) در E. integriceps میپردازد، که در تنظیم فیزیولوژیکی و رفتاری حشرات بسیار مهم هستند و اهداف بالقوهای را جهت توسعه حشرهکشهای زیستی جدید نشان میدهند. ما از توالییابی نسل بعدی (NGS) از طریق پلتفرم HiSeq2500 (Illumina) برای آنالیز ترانسکریپتوم E. integriceps با تمرکز بر پیشسازهای نوروپپتید و GPCRهای آن استفاده کردیم. رویکرد ما شامل سرهم بندی رونوشت جدید با استفاده از نرم افزار Trinity، تجزیه و تحلیل نمونههای RNA از کل بدن حشرات بالغ بود. این فرآیند 409588 کانتیگ وN50 با طول 693 برای E. integriceps به همراه داشت. این مطالعه 44 پیش ساز نوروپپتید را شناسایی کرد که بیشتر خانوادههای مختلف نوروپپتید حشرات به جز پیروکینین، تریسین، وازوپرسین و کلسیتونین را پوشش میدهند،. علاوه بر این، 85 گیرنده نوروپپتیدی فرضی شناسایی شد که سه کلاس (A، B، C) و LGR بود. نکته جالب توجه آن است که، GPCR های کلاس C، که به ندرت در حشرات راسته نیمبالان مشاهده شده اند در سن گندم گزارش شده است. گیرنده های نوروپپتیدی شناسایی شده شباهت قابل توجه 80 درصدی با گیرنده های مشابه در سن قهوه ای (Halyomorpha halys) نشان دادند. تجزیه و تحلیل ترانسکریپتوم پس از ساعت صفر، 72 ساعت گرسنگی و مراحل تغذیه مجدد 24 ساعت، بیان متفاوت قابل توجهی را در 498 ژن نشان دادند، از جمله آنزیم های مهم مانند تیروزین هیدرولاز و تیروزین کیناز، و نوروپپتیدهای کلیدی مانند پپتید شبه انسولین و آلاتواستاتین A که نقش مهمی در رفتارهای تغذیه ای حشرات دارند. یافتههای RNA-Seq از طریق آنالیزهای qRT-PCR نوروپپتیدهای دخیل در مکانیسمهای تغذیه تأیید شد. این تحقیق به بینشهای ارزشمندی در مورد فیزیولوژی و رفتار E.integriceps تعدیلشده با نوروپپتید کمک میکند و پایهای برای توسعه استراتژیهای هدفمند مبتنی بر نوروپپتید برای مدیریت آفات از جمله سن گندم ارائه میدهد.
|
|
پژوهشگران
|
محمد مجدی (استاد راهنما)، محمد رضا غفاری (استاد راهنما)، مهربانو کاظمی الموتی (دانشجو)، قاسم حسینی سالکده (استاد مشاور)
|