عنوان
|
سنتز سبز نانوذرات نقره با جدایههای قارچی و بررسی خواص ضد میکروبی آن همراه با مطالعه داکینگ مولکولی
|
نوع پژوهش
|
پایان نامه
|
کلیدواژهها
|
نانونقره، قارچ اندوفیت، بهینه سازی، آنتی اکسیدان، ضد میکروبی، داکینگ ملکولی
|
چکیده
|
نانوذرات نقره به دلیل خواص فیزیکی و شیمیایی ویژه خود دارای کاربردهای گستردهای در زمینه خواص ضدمیکروبی، آنتی اکسیدانتی و.... میباشند. امروزه سنتز زیستی نانوذرات نقره به دلیل سازگاری با محیط زیست بسیار مورد توجه واقع شده است. قارچها به دلیل تولید طیف متنوعی از متابولیتهای اولیه و ثانویه و همچنین پروتئینهای مختلف میتوانند نقش بسیار مهمی در زمینه سنتز زیستی نانوذرات نقره بازی نمایند. در واقع یافتن گونههای جدید قارچی دارای نقش در سنتز زیستی نانوذرات از جمله اهداف بسیار مهم در این زمینه است. علیرغم انجام پژوهشهای گسترده و معرفی گونههای قارچی دارای این توانایی تاکنون بسیاری از جنبههای مکانیسمی سنتز زیستی نانوذرات نقره توسط میکروارگانیسمها و از جمله قارچها مبهم باقی مانده است. در پژوهش حاضر برای نخستین بار عصاره عاری از سلول یک گونه اندوفیت قارچی از جنس Sarocladium برای سنتز زیستی نانوذرات نقره توسط سه پیش ماده نیترات نقره، استات نقره و سولفات نقره و پس از بهینهسازی فاکتورهای محیطی از جمله غلظت پیش ماده، pH اولیه عصاره، دما انکوباسیون و زمان انکوباسیون مورد استفاده قرار گرفت. در مرحله بعد مشخصهیابی نانوذرات نقره سنتز شده توسط تکنیکهای رایج در این زمینه انجام گرفت. در ادامه خواص ضدمیکروبی و آنتی اکسیدانتی این ذرات سنتز شده انجام شد. در ادامه جهت بررسی مکانیسم سنتز زیستی نانوذرات نقره توسط این قارچ، با دو رویکرد متابولومیکس غیرهدفمند و تخریب پروتئینهای عصاره عمل شد. به وسیله تکنیکهای مشخصهیابی تغییرات صورت گرفته در اندازه، شکل و پایداری ذرات سنتز شده توسط هر سه پیش ماده مورد مطالعه قرار گرفت. در نهایت مطالعات تکمیلی بیوانفورماتیکی از جمله داکینگ مولکولی، PASS، ProTox-II انجام گرفت. دراین مطالعه مشاهده گردید که نوع پیش ماده نمک نقره روی اندازه و پایداری نانوذرات نقره دارای نقش هستند، این در حالی است که شکل نانوذرات در اثر تغییر پیش ماده تغییری نکردند. همچنین در مورد مکانیسم سنتز دادههای متابولومیکس غیرهدفمند نشان دادند که حضور متابولیتهای احیاءگر دارای گروههای عاملی احیاءکننده برای سنتز زیستی نانوذرات نقره بسیار لازم هستند. همچنین تخریب پروتئینهای عصاره نشان داد که پروتئینها منجر به سنتز نانوذرات نقره با اندازه پایینتر و همچنین غلظت پایینتر میگردند. در واقع پروتئینها منجر به کند شدن زمان انکوباسیون میشوند. همچنین سنتز نانوذرات نقره توسط عصاره عاری از پروتئین نشان داد که وجود پروتئین روی میزان پایداری در مورد پیش مادههای نیترات نقره و استات نقره دارای نقش منفی و در مورد پیش ماده سولفات نقره تغییر چندانی ایجاد ننمودند. لازم به ذکر است که دادههای سمیت شناسی توسط پایگاه داده ProToX-II دادههای خوبی را در زمینه سمیت احتمالی متابولیتهای عصاره فراهم نمودند. همچنین از دادههای PASS برای پیشبینی متابولیتهای دارای خواص ضدمیکروبی استفاده شد. نتایج داکینگ مولکولی دید وسیعتری را در زمینه نحوه برهمکنشهای بین نانوذرات نقره و متابولیتهای عصاره با پروتئینهای هدف ضدباکتریایی فراهم نمود
|
پژوهشگران
|
مراحم آشنگرف (استاد راهنما)، نوید محمدجانی (دانشجو)
|