عنوان
|
بررسی بیوانفورماتیکی ژن لینالول سنتاز در خانواده ی لامیاسه و چندین خانواده ی گیاهی دیگر
|
نوع پژوهش
|
مقاله ارائه شده کنفرانسی
|
کلیدواژهها
|
ترپنوییدها، مونوترپنها، لینالول، لینالول سنتاز، لامیاسه، بیوانفورماتیک.
|
چکیده
|
ترپن ها یکی از مهم ترین گروه های تشکیل دهنده متابولیت های ثانویه گیاهی می باشند که دارای کاربردهای فراوانی در صنعت و پزشکی می باشند. یکی از مهم ترین گروه ترپن ها، مونوترپن ها می باشند. لینالول از جمله مونوترپن هایی است که علاوه بر مصرف زیاد در صنایع آرایشی بهداشتی در درمان بیماریهایی مانند سرطان سینه و نیز درمان لوسمی مورد استفاده قرار می گیرد. این ماده در گیاهان توسط لینالول سنتاز از پیش ساز عمومی مونوترپن ها یعنی ژرانیل دی فسفات تولید می شود. با توجه به اهمیت بالای این دسته از متابولیت های ثانویه گیاهی، بررسی و شناخت بیشتر این متابولیت ها حائز اهمیت می باشد. ژن کدکننده ی این آنزیم در گونه های مختلف گیاهی از جمله در حانواده ی لامیاسه در دو جنس منتا و پریلا توالی یابی شده است. هدف از این تحقیق مطالعه بیوانفورماتیکی ژن مزبور میباشد. ابتدا توالی های آمینواسیدی لینالول سنتاز مربوط به چندین خانواده ی گیاهی از پایگاه اطلاعاتی NCBI دریافت شد. سپس با استفاده از نرم افزار clustalW، همردیفی توالیها صورت گرفت و درخت فیلوژنی این پروتیین رسم شد. نتایج نشان میدهد که پروتیین لینالول در خانواده Lamiaceae رابطه فیلوژنی نزدیکتری با جنسvar. Thunbergii Osmanthusfragrans از خانواده Oleaceae و جنس Backhousi acitriodora از خانواده Myrtaceae دارد. سایز این پروتیین در بین گیاهان تحت بررسی در محدوده 871-569 اسید آمینه است. بیشترین وزن آن متعلق به گونه Clarkia concinna میباشد. نقطه ایزوالکتریک این پروتیین در محدوده 7-5 است و بیشترین شاخص آلیفاتیک که به عنوان یک عامل مثبت برای افزایش مقاومت حرارتی می باشد مربوط به گونه Solanum lycopersicum است.
|
پژوهشگران
|
محمد مجدی (نفر دوم)، ریزان الیاسی (نفر اول)
|