رئوف قوامی زروان

در این رساله، CoMFA و داکینگ مولکولی برای مدل سازی فعالیت ضد سرطانی ترکیبات جدید و بررسی برهمکنش های آن ها با مکان اتصال هدف مورد استفاده قرار گرفتند. این ترکیبات متوقف کننده آنزیم هایی هستند که عملکرد آن ها برای حیات سلول های سرطانی حیاتی است و متوقف سازی آن ها سلول سرطانی را می کشد. براساس مطالعات CoMFA و داکینگ مولکولی این مولکول ها، ترکیبات جدید و با فعالیت بیش تر طراحی شدند. در اولین کار انجام گرفته، یک مدل CoMFA با سه جزء اصلی برای پیش بینی فعالیت متوقف کنندگی 1،7- دی آزا کربازول ها به عنوان متوقف کننده های کیناز 1 نقطه وارسی ایجاد شد و براساس نتایج داکینگ مولکولی برهمکنش های فارماکوفری این ترکیبات با مکان اتصال 3DX آنزیم Chk1 تعیین شدند. براساس نتایج داکینگ مولکولی و CoMFA متوقف کننده های فعال تر Chk1 تعیین شدند. در دومین تحقیق براساس CoMFA، LS-SVM و RBFNN سه مدل برای پیش بینی فعالیت مشتقات نفتیریدون به عنوان متوقف کننده های برومودومین ATAD2 ایجاد شدند و داکینگ مولکولی برای بررسی برهمکنش های این ترکیبات با مکان اتصال برومودومین ATAD2 استفاده شد. براساس نتایج داکینگ مولکولی و نقشه های CoMFA خصوصیات مهم ساختار شیمیایی این ترکیبات که فعالیت متوقف کنندگی آن ها را افزایش می دهد، شناسایی شدند. در کار سوم، رویکرد های LBVS و SBVS برای جستجوی 23129083 ترکیب تمیز در پایگاه داده ZINC به منظور شناسایی متوقف کننده های برومودومین ATAD2 به کار گرفته شدند و سرانجام 6 ترکیببه عنوان متوقف-کننده برومودومین ATAD2 درنظر گرفته شدند. در کار چهارم براساس مطالعه CoMFA و داکینگ مولکولی تیازولوکون (آز)ولین (ون) ها متوقف کننده های جدید CD38 طراحی شدند و مکانیسم متوقف کنندگی این ترکیبات مشخص شد. در کار پنجم براساس پویش پایگاه داده ZINC به وسیله رویکرد های LBVS و SBVS پنج ترکیب به عنوان متوقف کننده CD38 شناسایی شدند. در تحقیق بعدی براساس مطالعه CoMFA و داکینگ مولکولی ترکیبات مبتنی بر کربونیل α و β – سیرنشده و همرده های اکسیم به عنوان متوقف کننده های پ – گلیکوپروتئین، چهار متوقف کننده جدید با فعالیت بیش تر از فعال ترین ترکیب در مجموعه داده استفاده شده طراحی شدند. در کار بعدی، CoMFA، LS-SVM و RBFNN برای مدل سازی فعالیت متوقف کنندگی KDM4A، ،KDM4، KDM5B و KDM5C مشتقات پیریدو [3، 4- دی] پیریمی