محمد حاجی زاده

به منظور بررسی آنالیز تبارزایی، تنوع ژنتیکی و فشار انتخاب بر ژن پروتئین پوششی جدایه های ویروس موزاییک زرد کدو (ZYMV)، هفت جدایه B10، B21، B22، H7، W5، Z3 و Z14 از غرب کشور و از میزبان های متفاوت تعیین توالی شدند و با 64 جدایه قابل دسترس در پایگاه داده های نوکلئوتیدی مورد مقایسه قرار گرفتند. همریف سازی توالی ها و ترسیم درخت تبارزایی جدایه های این ویروس بر اساس 432 نوکلئوتید از ژن پروتئین پوششی در نرم افزار MEGA6 و برآوردهای تنوع ژنتیکی و فشار انتخاب وارد بر پروتئین پوششی با نرم افزارv.5.10.05 DnaSP انجام شد. نتایج همردیف سازی توالی ها نشان داد که جدایه های این تحقیق 86-100% با همدیگر و 85-99% با سایر جدایه های ایرانی تشابه نوکلئوتیدی داشتند. در بررسی تبارزایی، جدایه ها در سه گروه مجزا تفکیک شدند که جدایه های B10، B21، B22، H7 و Z3 در گروه جدایه های ایرانی و اروپایی و دو جدایه Z14 و W5 در گروهی مجزا همراه با جدایه های شرقی قرار گرفتند که نشاندهنده دو دودمان متفاوت جدایه های ZYMV در ایران است. بررسی نوترکیبی با نرم افزار v.4.63 RDP4 حاکی از عدم نوترکیبی در این بخش از ژنوم بود.