استخراج DNA با کیفیت و کمیت مناسب در مطالعات مولکولی امری بسیار ضروری است. دستیابی به روشی یا روشهایی که به سهولت برای استخراج DNA از زنبورعسل کوچک Apis florea که یکی از دو گونه زنبورعسل موجود در ایران است، میتواند حائز اهمیت باشد. در این مطالعه چهار روش استخراج DNA شامل بهینه نمکی، فنل- کلروفرم CTAB و CTAB+SDS به منظور گزینش مناسبترین روش استخراج DNA زنبورعسل مورد ارزیابی و آزمایش قرار گرفت، سپس کیفیت و کمیت DNA استخراجی با استفاده از روشهای اسپکتوفتومتری و ژل آگارز مورد مقایسه قرار گرفت. در پایان با توجه به کمیت و کیفیت DNA استخراج شده، روش CTAB+SDS برای استخراج DNA از زنبورعسل کوچک قابل توصیه است.