اندوفیت ها، قارچ ها و باکتری های داخل برگ، ساقه و ریشه اغلب گیاهان هستند که در فیزیولوژی گیاهان نقش های متنوعی را ایفا میکنند. این میکروارگانیسم ها متابولیت های متنوع با خواص مختلفی را ترشح می کنند که از جمله این خواص می توان به خاصیت ضدقارچی و ضدباکتریایی برخی از آنها اشاره نمود. در این تحقیق 170 جدایه قارچ اندوفیت از اندام های مختلف برخی از گیاهان خانواده سولاناسه جداسازی شدند. بررسی-های مورفولوژی نشان دهنده ی تنوع در قارچ های جداسازی شده بود. به منظور شناسایی مولکولی 10 جدایه انتخابی، از توالی ژنهای Calmodulin، RPB2 و ITS استفاده شد. نتایج مطالعات ریخت شناسی و مولکولی نشان داد که این جدایه ها متعلق به گونه های Alternaria tenuissima، Aspergillus aculeatus، Aspergillus awamori،Aspergillus tubingensis و Penicillium citrinum می باشند.