قارچ های اندوفیت بخشی از اجزای مهم تنوع زیستی مرتبط با گیاهان هستند و قادر هستند که تمام بافت های داخلی گیاهان را کلنه کرده و سبب بهبود سلامت گیاه گردند. آنها می توانند با بیمارگرهای گیاهان برای فضا و غذا از نظر اکولوژیکی رقابت کرده و موجب کاهش بیماری در گیاهان شوند. به منظور شناسایی قارچ های اندوفیت از برگ، تنه و پوست شاخه های سالم درختان بلوط گونه های Quercus brantii Lindl و Quercus infectoria Oliv در استان کردستان از مناطق بانه، کامیاران و مریوان نمونه برداری به صورت تصادفی انجام گردید. نمونه ها در آزمایشگاه به قطعات نیم تا یک سانتیمتری تقسیم و پس از ضدغفونی با هیپوکلرید سدیم 5% و اتانول 70% با آب مقطر سترون شستشو داده و پس از خشک کردن روی کاغذ صافی سترون روی محیط سیب زمینی- دکستروز – آگار حاوی آنتی بیوتیک داکسی سایکلین (150 میلی گرم در لیتر) در دمای 25 درجه سانتی گراد کشت گردید. شناسایی گونه ها براساس خصوصیات ریخت شناختی و توالی ناحیه ITS-rDNA انجام گردید. بر این اساس از 75 جدایه، گونه های Peyronellaea glomerata (Corda)، Truncatella angustata (Pers.) Hughes، Ulocladium botrytis (Preuss)، Microsphaeropsis olivacea (Bonord.)، Chaetomium subaffine (Sergeeva)، Trichoderma citrinoviride (Bissett) و Trichoderma atroviride (P. Karst)` شناسایی شدند. دو گونه Chaetomium subaffine و Ulocladium botrytis بیشترین فراوانی را در در بین قارچ های جدا شده از بافت های مورد مطالعه به خود اختصاص دادند. علاوه بر این، بیشترین جدایه های اندفیت به ترتیب از بافت ساقه و تنه درختان بلوط گونه Q. brantii جداسازی گردید.
