کشمش یکی از محصولات صادراتی مهم ایران است. آلودگی با قارچ ها از مهمترین خطرات سلامت در ارتباط با مصرف کشمش است. با توجه به تولید بالای انگور و کشمش در کشور و به ویژه در شهرستان ملایر، ردیابی سریع قارچهای تولیدکننده سم اکراتوکسین A برای پیشگیری از آلودگی این محصول از حیث امنیت غذایی بسیار ضروری است. به منظور ردیابی قارچ های احتمالی در کشمش از روش مولکولی PCR استفاده شد. ابتدا جداسازی وکشت قارچ های آلوده کننده احتمالی کشمش انجام شد. بررسیهای مورفولوژیکی نشان داد که قارچ ها ی جدا شده متعلق به آسپرژیلوس میباشند. ژن بتاتوبولین به عنوان یک ژن شاخص برای شناسایی این قارچ ها انتخاب شد. نتایج PCR نشان که همه کشمش های مورد بررسی آلوده به یکی از دو گونه Aspergillus niger یا Aspergillus tubingensis هستند.