توت فرنگی یکی از میوه های مهم و قابل توجه برای مصرف کنندگان می باشد. باکتری های اندوفیت رشد گیاه را بهبود بخشیده و سبب افزایش تولید متابولیت های موثر در گیاه می شوند. در این پژوهش، باکتری های اندوفیت ازمیوه دو رقم توت فرنگی از سه منطقه مختلفاستان کردستان جداسازی شد و پس از خالص سازی، تراکم آن ها طی مراحل مختلف رسیدگی میوه، مورد بررسی قرارگرفت. نتایج به دست آمده بر اساس تعیین توالی 16s rRNAنشان داد که باکتری جدا شده متعلق به جنس متیلوباکتریوم (Methylobacterium) می باشد. تراکم این باکتری ، در طی مراحل مختلف رسیدگی میوه در دو رقم مورد مطالعه، تفاوت معناداری نشان داد (p<.05).همچنین تراکم باکتری در رقم کردستان در منطقه نشور بطور معنی داری بیشتر از سایر مناطق مورد مطالعه بود (p<.05).نتایج حاصل از این پژوهش نشان داد که تراکم باکتری اندوفیت در ارقام مختلف، مناطق جغرافیایی مختلف و همچنین مراحل مختلف رسیدگی میوه متفاوت است.