به منظور بررسی وضعیت ذخایر ماهی بومی و دارای ارزش اقتصادی حوزه رودخانه قشلاق سنندج، نمونه برداری از ماهیان این رودخانه طی چهار فصل انجام گرفت. نتایج ماهی شناسی نشان دهنده حضور 21 گونه ماهی در این حوزه است که 10 گونه آن بومی منطقه و 11 گونه ماهیان غیر بومی می باشند. گونه های کپور معمولی، کپور نقره ای، کپور سرگنده، کپور علفخوار و ماهی سفید دریای خزر از گونه های غیر بومی می باشند که به منظور اهداف آبزی پروری به دریاچه سد قشلاق سنندج معرفی شده اند. از میان 10 گونه ماهی بومی سه گونه آن؛ سیاه ماهی فلس ریز، سیاه ماهی خالدار و ماهی سفید رودخانه ای دارای فراوانی بالا و ارزش اقصادی می باشند. در این مطالعه ساختار سنی و طولی این گونه ها و چگونگی رشد و تولید مثل آنها تعیین گردید. همچنین با توجه به ضرایب بهره برداری و مرگ و میر این گونه ها در حوزه رودخانه قشلاق وضعیت ذخایر آنها مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج نشان دهنده تحت فشار بودن هر سه گونه در منطقه مورد بررسی است. لذا اعمال مدیریت با اصلاح و بهبود زیستگاه این گونه ها و مدیریت بهره برداری آنها توصیه می گردد.