1403/01/10
بهمن بهرام نژاد

بهمن بهرام نژاد

مرتبه علمی: دانشیار
ارکید:
تحصیلات: دکترای تخصصی
اسکاپوس: 26027392500
دانشکده: دانشکده کشاورزی
نشانی: کردستان، سنندج، بلوار پاسداران، دانشگاه کردستان کدپستی: 15175-66177
تلفن: 09188723697

مشخصات پژوهش

عنوان
شناسایی بیوانفورماتیکی ژن های هدف چند میکروRNA جدید در انگور
نوع پژوهش
مقاله ارائه شده کنفرانسی
کلیدواژه‌ها
انگور، روش های بیوانفورماتیکی، میکروRNA، ژن هدف، psRNATarget.
سال 1394
پژوهشگران سهیلا فاطمی ، بهمن بهرام نژاد ، جلال رستم زاده

چکیده

میکرو RNA ها کلاسی از RNA های کوچک 24-20 نوکلئوتیدی درونزاد هستند که نقش های مهمی را در تنظیم پس از ترجمه ژن از طریق هدف قرار دادن mRNA ها برای برش یا سرکوب ترجمه ایفا می کنند. تمام پیش سازهای miRNAs دارای ساختارهای ثانویه حفظ شده مشابهی هستند که به کمک آن و با استفاده از روش های محاسباتی، وجود اورتولوگ ها یا همولوگ های میکروRNA های جدید را در دیگر گونه های گیاهی می توان پیش بینی کرد. بر این اساس و پس از رعایت مجموعه ای از ضوابط، تعداد 25 میکروRNA جدید متعلق به 3 خانواده mir-845 ، mir-5523و mir-171 در انگور شناسایی شد. به منظور درک نقش miRNAs جدید در شبکه های تنظیم ژن در انگور، تعداد 27 ژن هدف برای این 3 خانواده miRNAs با استفاده از پایگاه اطلاعاتی psRNATarget شناسایی شد که بیانگر عملکرد آنها در پروسه های مختلف بیولوژیکی از جمله متابولیسم، نمو، کنترل تقسیم سلولی، مورفوژنز و انتقال سیگنال است. این داده ها اطلاعات مفیدی را پیرامون توصیف عملکرد miRNAs در انگور فراهم آورد