1403/02/15
امیر رشیدی

امیر رشیدی

مرتبه علمی: استاد
ارکید:
تحصیلات: دکترای تخصصی
اسکاپوس: 23009961900
دانشکده: دانشکده کشاورزی
نشانی: سنندج- دانشگاه کردستان- دانشکده کشاورزی - گروه علوم دامی
تلفن: 08733668512

مشخصات پژوهش

عنوان
استنباط روابط علی بین ژنهای هاب ترانسکریپتومی و بافت پستانی گاوهای شیری با مدل سازی معادلات ساختاری
نوع پژوهش
مقاله ارائه شده کنفرانسی
کلیدواژه‌ها
بار عاملی، ریزآرایه DNA، ژنهای هاب، متغیر پنهان
سال 1397
پژوهشگران امین مرتضوی ، امیر رشیدی ، مصطفی قادری زفره ای ، پرهام مرادی دولت آبادی ، محمد رزم کبیر

چکیده

هدف از این پژوهش، استخراج روابط علی- معلولی بین ژنهای هاب ترانسکریپتومی و بافت پستانی در داده های بیان ژنی ریزآرایه DNA با استفاده از مدل سازی معادلات ساختاری بود. بدین منظور داده ریزآرایه با شماره دسترسی GSE24560 از پایگاه اطلاعاتی GEO استخراج شد. مدل سازی معادلات ساختاری و استخراج روابط علی-معلولی بین ژنهای هاب در بافت پستانی با استفاده از Amosنسخه 24انجام گرفت. ژنهای هاب و بافت پستانی بهترتیب به عنوان متغیرهای آشکار و پنهان استفاده شدند. نتایج حاصل از این پژوهش نشان داد که تمامی 4ژن هاب ترانسکریپتومی به غیر از LOC616942 دارای بارهای عاملی در ارتباط با متغیر پنهان (بافت پستان) بودند. درنهایت توصیه میشود در مدل سازی روابط ژنی به روش معادلات ساختاری، متغیرهای پنهان و آشکار (صفات و SNPها و مسیرهای متابولیکی) بیشتری مورداستفاده قرار گیرد.