برونشیت عفونی پرندگان بیماری حاد، بسیار مسری با انتشار جهانی می باشد که علی رغم واکسیناسیون علیه آن گزارشاتی از شیوع و ظهور ویروس مشاهده می شود. جهش های نقطه ای و نوترکیبی ژنوم ویروس موجب تکامل مداوم آن شده، بنابراین ظهور واریانت های ویروس برونشیت عفونی پرندگان کنترل این بیماری را پیچیده نموده است. در این مطالعه توالی زیرواحد ژن S از 18 سویه رفرنس با 25 جدایه ایرانی به دست آمده از بانک ژن مورد بررسی قرار گرفت. توالی های مورد بررسی با نرم افزارBioEdit هم ردیف شدند. با ترسیم درخت فیلوژنی این 43 سویه به پنج گروه اصلی I, II, III, IV, V تقسیم شد. سویه های گروه کشنده (I) شامل جدایه های ایرانی (,IR/8/2011 IRFIBV (13b, 4, 13, 6, 9, 20, 7, 31), IR-Razi-HKM3-2010,)، جدایه ترکیه ای (chicken/Turkey/10RS-3161/2010)، جدایه عراقی (Sul/01/09) و جدایه های SH1, A2, T است. استرین های گروه بیماری زای خفیف (II) شامل جدایه های ایرانی (IR/43/08, IR/11/2011, H120 (IR), IR/70/02) و جدایه های Conn, H120, H52, Ma5, M41, TAE340552 می باشد. استرین های گروه بیماری زای شدید (III) شامل جدایه ایرانی ( PCRLab/06/2012) و جدایه هایSDLY0612, QXIBV, A2-2 و گروه بیماری زای بسیار شدید (IV) شامل جدایهQu16, Gray و گروه بیماری زای متوسط V)) شامل جدایه های ایرانی ( IR/573/98, IR-1062-GA, IR-3654-VM, IR-1061-PH, IR/525/99, IR/14/07, IR/14/2011, IR-Razi-HKM4-2010, IR/19/08, 4/91 (IR))، جدایه های 4/91) ،CR8812) می باشد. تشابه بین جدایه های مختلف ایرانی بین 96/99-7/72 % بود که حداقل آن بین جدایه های گروه (II) با گروه (V) بود. واکسن های این بیماری که همگی وارداتی می باشند، تشابه ژنتیکی آن ها با سویه های ایرانی مطابقت کامل ندارد و کارایی لازم را ندارند لذا تولید واکسن از سویه های ایرانی برای افزایش کارایی پیشنهاد می گردد.