37 توده سیر جمع آوری شده از مناطق اصلی کشت و کار سیر در ایران برای ارزیابی تنوع ژنتیکی و مقایسه با سه توده خارجی مورد بررسی قرار گرفتند. با استفاده از 5 ترکیب پرایمری اکوآروان و ام اس ای وان دارای 3 نوکلئوتید انتخابی 330 نشانگر حاصل آمد که 233 نشانگر (5/70%) چندشکلی نشان دادند. دندروگرام رسم شده بر اساس نتایج حاصل از تجزیه خوشه ای توده های سیر ایرانی و خارجی را در 8 گروه اصلی قرار داد. تشابه بین خوشه ها نسبتاً بالا(58 تا 100%) بود مخصوصاً در مورد توده های سیر ایرانی تا جایی که تعداد زیادی از این توده ها درجه شباهت بالایی (بیش از 95%) نشان دادند. 8 توده از گروه 1 و 8 توده ازگروه 5 صددرصد از باندهای درون گروه خود را به اشتراک بردند، که احتمال تکراری بودن آنها را نمایان می سازد. از 3 توده خارجی توده ایتایایی به تنهایی یک گروه را تشکیل داد و توده دیگر نیز زیر گروه هایی را تشکیل دادند. در کل همبستگی زیادی بین تنوع ژنتیکی و پراکنش جغرافیایی توده های سیر ایرانی مشاهده شد وبر اساس نتایج حاصل از داده های آ اف ال پی سه توده خارجی مورد ارزیابی فاصله ژنتیکی نسبتاً زیادی با توده های ایرانی داشتند. این تحقیق نشان داد که تکنیک آ اف ال پی نه تنها توانایی تفکیک و شناسایی گونه ها را دارا می باشد، بلکه اجازه تفکیک واریته های گیاهشناسی و اکوتیپ های مختلف را نیز به خوبی فراهم می سازد. نهایتاً تکنیک انگشت نگاری آ اف ال پی با شناسایی توده های تکراری در مجوعه های ژرم پلاسم می تواند کمک فراوانی به کاهش هزینه نگه داری مخصوصاً در مورد سیر که به صورت رویشی تکثیر می گردد داشته باشد.
