مطالعه کیفیت آب های زیرزمینی مناطق کارستی از اهمیت بسیاری برخوردار است. در این پژوهش، آلودگی شیمیایی آب های کارستی سه غار سهولان، قوری قلعه و کرفتو ارزیابی شده اند. برای ارزیابی مخاطره آلودگی آب کارستی غارهای مورد مطالعه، کیفیت سنجی عناصر و پارامترهایی شامل : ,So 4,Mg, Na, Ca, K, Li, pH, Ec, Mn, Fe , As, Pb ,No3 Cl TDS,BOD, در آزمایشگاه انجام شده است و از طریق نمونه برداری و آزمایش های شیمیایی، نتایج مشخص و تحلیل شده اند. همچنین از طریق بازدیدهای میدانی و مصاحبه با کارشناسان مرتبط، نقش عوامل موثر در آلودگی آب غارها شناسایی شده اند. نمونه برداری از قسمت های مختلف غار و بیرون غار صورت گرفته است و هدایت الکتریکی (EC) نمونه آبها با EC متر بدست آمده و اسیدیته یا قلیایی بودن آب pH متر مشخص گردیده است. آرسنیک و سرب به روش کوره گرافیتی دستگاه جذب اتمی، آهن، منیزیم و منگنز به روش شعله ای، سدیم، پتاسیم،کلسیم و لیتیم به روش فتومتری،TDS با TDS متر، کلر به روش تیتراسیون، سولفات به روش تربید متریک، BOD با BOD متر و نیترات به روش یون کروماگرافی IC انجام گرفته است. سپس نتایج آزمایشگاهی غلظت ها با معیارهای استاندارد آب آشامیدنی مقایسه شده اند. براساس نتایج، غلظت عناصری مانند آرسنیک، آهن، منگنز، سرب و منیزیم نمونه ها از حد مجاز آب آشامیدنی بیشتر است که بر اساس بازدیدهای میدانی و مصاحبه با کارشناسان مرتبط بیشتر ناشی از فرایندهای طبیعی مثل شستشوی خاک و اختلاط با منابع آب زیرزمینی آلوده یا فعالیت های انسانی مثل دفع مواد زاید، معدن کاری و فعالیت های کشاورزی در مناطق مربوطه می باشد.