مشاوره و رواندرمانی اگرچه در بحث نظری بسیار مورد بحث و بررسی قرار گرفته است اما در عمل ممکن است چالش های اساسی ایجاد شود. از مهمترین چالش ها، موضوع اخلاق در مشاوره است؛ در بسیاری اوقات مشاوران با تصمیم گیری های اخلاقی و دشوار همچون موضوعات خودکشی و جنسی و قانونی و ... روبه رو می شوند. در تمام این موارد مشاوران نیازمند دوره های کارورزی و آموزش های تحت سرپرستی ناظران هستند. در این دوره ها مشاوران می توانند دیدگاه بهتر و دقیق تری نسبت به این موضوعات کسب نمایند.