محمد مجدی

تیمول یک مونوترپن فنولی است که دارای 3 گروه متیل، یک حلقه بنزنی و یگ گروه هیدروکسیل با فرمول شیمیایی C10H14O می باشد. مونوترپن ها از مسیر MEP سنتز می شوند. در این مطالعه توالی های اسید آمینه ی مربوط به آنزیم های مسیر تولید مونوترپن ها از پایگاه اطلاعاتی NCBI دریافت شد و توالی هایی دیگر نیز از پایگاه اطلاعاتی phytozome با استفاده از بلاست توالی های ژن های DXS، DXR، MCT، CMK، MDS، HDS، HDR ، GDS، TPS، CYP مسیر تولید مونوترپن ها در آرابیدوپسیس علیه ژنوم گیاهان باقی مانده صورت گرفت. همردیفی توالی های پروتئین های بدست آمده با استفاده از نرم افزار ClustalW انجام شد، و در نهایت با استفاده از نرم افزار MEGA4 و با روش نزدیک ترین همسایگی و با بوت استرپ 100 رابطه فیلوژنی مربوط به توالی ها رسم شد. درخت فیلوژنی ژن DXS دخیل در مسیر بیوسنتزی مونوترپن در 27 گونه گیاهی و ریزسازواره ها رسم شده است، که این درخت فیلوژنی مربوط به 20 گونه گیاهی و 6 گونه باکتریایی و 1 گونه مخمر می باشد، که این گونه ها در هشت گروه مجزا قرار می گیرند که در آن توالی های مربوط به گیاهان در دو گروه قرار گرفته است و توالی های مربوط به باکتری ها در پنج گروه تقسیم بندی شده اند و مخمر Saccharomyces cerevisiae در گروه مجزا قرار گرفته شده است. برخی از گونه های گیاهی دارای چندین ایزوفرم از ژن می باشند.