محمد حاجی زاده

ویروئید کوتولگی رازک (Hop stunt viroid, HSVd) متعلق به جنس هوستاویروئید، خانواده پوسپی ویروئیده که حاوی RNA 207 بوده و دامنه وسیعی از میزبانهای چوبی مانند مو، گونه های مرکبات و هسته داران - تک لای حلقه ای با طول کامل 792 را آلوده می کند. در این تحقیق، 722 نمونه از برگهای مو تاکستانهای شمالغرب کشور در طی تابستان 7239 جمع آوری شد. اسید نوکلئیک کل از بافت برگ نمونه ها استخراج و پس از ساخت cDNA با استفاده از آغازگر شش نوکلئوتیدی تصادفی، طول کامل این ویروئید با روش PCR و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی، تکثیر شد. محصول PCR از چهار جدایه از ژل آگاروز خالص سازی و پس از اتصال به حامل pGEMT-easy ، در باکتری مستعد شده Escherichia coli استرین DH5α همسانه سازی شد. ترادف نوکلئوتیدی محصولات PCR با استفاده از آغازگرهای M13 در شرکت MWG )کشور آلمان( با روش اتومات به دست آمد. نتایج RT-PCR نشان داد که همه نمونه های مورد مطالعه، آلوده به این ویروئید بودند. توالی های به دست آمده از این ویروئید، حاوی 297 نوکلئوتید که 99 - 100%در بین توالی ها و همچنین با توالی مرجع از مو (E01844) و 87-100% با دیگر توالیهای موجود در ژنبانک تشابه نوکلئوتیدی نشان دادند. در کل، یک واریانت جدید از این ویروئید شناسایی شد که تنها یک نوکلئوتید آن در موقعیت 83 (تبدیل گوانین به آدنین) با توالی مرجع در منطقه حفاظت شده مرکزی تفاوت داشت.