به دلیل اندازه کوچک ویروئیدها (246 تا 436 نوکلئوتید)، عدم توانایی در تولید پروتئین و ایجاد برخی از بیماریها با شدت بالا، "مکانیسم بیماریزایی ویروئیدها در میزبان" یکی از جنبه های جذاب مطالعه آنها به شمار میرود. تعامالت مستقیم و غیرمستقیم ویروئیدها با فاکتورهای میزبانی در مطالعات مختلف به اثبات رسیده است که منجر به تغییر در پروتئوم، رونوشت های میزبان و در نتیجه بیماری در گیاهان شده است. آخرین مدل ارایه شده برای چنین تغییراتی، مکانیسم خاموشی RNA می باشد که اکنون در هر دو خانواده ویروئیدی مورد تأیید قرار گرفته است. در این مقاله مروری، سعی بر این است که آخرین مطالعات در این زمینه مورد بحث قرار گیرد.
