روند تخلیص یک پروتئین در نهایت بایدنمونه ای از پروتئین تولید نماید که تنها حاوی یک نوع مولکول باشد وآن پروتئین مورد نظر بیوشیمیست می باشد. در این مسیر محقق به یک روش سنجش منحصر به فرد برای پروتئین مورد نظر نیاز داردتا بتواند در هر یک از مراحل خالص سازی حضور و میزان پروتئین مورد نظر را تائید و برآورد نماید. تقریباً به تعداد پروتئین ها روش تخلیص وجود دارد و این محقق است که باید به مناسب ترین روش برای تخلیص یک پروتئین خاص برسد.
