علاوه بر بدن موجودات زنده آنزیم ها همواره نقش مهمی را در زندگی بشر بازی کرده اند. انسان ها بدون اینکه بدانند طی هزاران سال از این کاتالیزورهای طبیعی بهره گرفته اند. تولید سرکه، پنیر، خمیر ترش و بسیاری دیگر از مواد غذایی بدون کمک آنزیم ها امکان پذیر نبوده و همچنین صنایعی مانند نساجی و رنگ از وجود این مواد بهره های فراوانی برده اند. در زمانی که تولید این ترکیبات در آزمایشگاه و واحدهای بزرگ صنعتی میسر نبود آنزیمها یا توسط میکروارگانیسم ها در طی فرایند تولید، سنتز می شدند و یا به همراه مواد اولیه وارد پروسه تولید می شدند(مانند آنزیم هایی که در میوه پاپایا و شکمبه گوساله موجود است)؛ طبیعتا هیچ یک از این آنزیم ها خالص نبودند.