ملیتین یک پپتید حاصل از نیش زنبور عسل است که تا به امروز تحقیقات زیادی به صورت تجربی و محاسباتی روی آن انجام شده است[1]. اگر چه شواهد مثبتی از قابلیت کاربرد این پپتید برای درمان بسیاری از بیماری ها از جمله سرطان و دیابت و عفونت های باکتریایی گزارش شده [2و3]، اما مصرف آن به عنوان دارو همواره عوارض جانبی به همراه داشته است. بررسی ها نشان داده که این پپتید می تواند اثرات سمی بر روی گلبول های قرمز و سلول های سالم بدن داشته باشد[4]. به منظور بر طرف ساختن این مشکل باقری و همکاران در صدد اصلاح آن برآمده و پپتید MDP1 را طراحی نمودند. این اصلاح شامل حذف دو آمینو اسید آبگریز و یک آمینواسید آب دوست از مجموع 26 آمینو اسید ملیتین است. نتایج تجربی نشان داده که ساختار اصلاح شده با وجود خاصیت ضدباکتریایی قویتر252 بار از ملیتین سمیت کمتری دارد. با این وجود این نتایج قادر به مشخص ساختن علت خواص مشاهده شده نیستند [5]. بر این اساس در تحقیق حاضر محاسبات دینامیک مولکولی به منظور بررسی جزئیات مولکولی این اصلاح و علت احتمالی اثرات مشاهده شده انجام شده است.
