برهم کنش رادیکال های هیدروکسیل، فنیل و فنوکسی با جفت بازهای تشکیل دهنده DNAدو رشته ای، آدنین- تیمین و گوانین-سیتوزین، با استفاده از روش DFT مورد بررسی قرار گرفته است. برهم کنش رادیکال ها از هر دو طرف بالا و پایین با هریک از جفت بازها در حالت گازی و در حلال آب بررسی شده است. برای هر کمپلکس جفت باز- رادیکال ساختار هندسی با استفاده از روش B3LYP-6311G(d,p) بهینه شده و محاسبات انرژی وNBO در سطح محاسباتی B3LYP/6-311G++(d,p) انجام شده است. خواص ساختاری شامل طول پیوندهای هیدروژنی و زاویه دو وجهی اجزای هر جفت باز و خواص الکترونی شامل انتقال بار بین رادیکال و جفت باز، سطح انرژی اربیتال هایHOMO وLUMO و شکاف انرژی برای هر کمپلکس جفت باز- رادیکال استخراج شده است. نتایج بدست آمده نشان می دهند که رادیکال فنوکسی نسبت به رادیکال های هیدروکسیل و فنیل تاثیر بیشتری بر ساختار آدنین- تیمین داشته و جفت باز گوانین- سیتوزین نیز تغییرات ساختاری اصلی را در حضور رادیکال فنیل متحمل می شود. از نظر انرژی اتصال، در حالت گازی کمپلکس گوانین-سیتوزین-هیدروکسیل و در حلال آب کمپلکس آدنین-تیمین-فنیل بر سایر ساختارها ارجحیت دارند. نتایج این تحقیق نشان می دهد که در همه موارد رادیکال ها می توانند کمپلکس پایدار با جفت بازهای آدنین-تیمین و گوانین-سیتوزین تشکیل داده و با تضعیف پیوندهای هیدروژنی و تغییر زاویه دو وجهی باعث تغییر ساختار هندسی جفت باز گردند و از اینرو هرسه رادیکال می توانند بطور بالقوه نسبت به سلول های انسان دارای خاصیت سرطانزایی باشند.