مسأله تخصیص استاد و زمان بندی دروس در دانشگاه های علوم پزشکی گونه ای تعمیم یافته از زمان بندی دروس دانشگاه است که شامل تخصیص دروس و وظایف آموزشی و پزشکی به اساتید در یک دوره زمانی (نیمسال یا سال تحصیلی) با در نظر گرفتن ترجیحات آنها و برآورده کردن مجموعه ای از محدودیت های مختلف است. در تحقیقات مرتبط با این حوزه، مسأله زمان بندی دروس در دانشگاه و زمان بندی پزشکان عضو هیأت علمی در بیمارستان برای شیفت های کاری به صورت مستقل از هم انجام شده است. در این پایان نامه هر دو حوزه کاری با هم تلفیق شده و یک مدل برنامه ریزی خطی عدد صحیح مختلط چندهدفه ارائه می شود. محدودیت های ویژه ای برای مسأله ی مورد مطالعه وجود دارد؛ از آن جمله می توان به مدنظر قرار دادن تعداد استاد تخصیص داده شده به هر وظیفه یا درس، محدود بودن موظفی هر استاد، عدم تداخل زمانی وظایف و در نظر داشتن سبد درسی برای اساتید اشاره کرد. مدل پیشنهادی شامل دو معیار بهینه سازی است که معیار اول متوازن کردن بارکاری آموزشی و پزشکی اساتید و معیار دوم بیشینه کردن ترجیحات اساتید برای دروس و وظایف آموزشی و پزشکی با در نظر داشتن مرتبه علمی اساتید است. معیارهای ذکر شده در قالب سه تابع هدف در مدل ریاضی وارد می شوند. برای حل مدل ارائه شده از روش محدودیت اپسیلون بهبود یافته دوم استفاده می شود. در نهایت با به کارگیری داده های واقعی، مدل ارائه شده برای زمان بندی دروس و وظایف پزشکی در بخش عفونی دانشگاه علوم پزشکی کردستان، مورد استفاده قرار می گیرد. مدل با استفاده از روش محدودیت اپسیلون بهبود یافته دوم در نرم افزار بهینه ساز GAMS حل شده و جواب های پارتویی مسأله به دست می آید. در نهایت با در نظر گرفتن نظر دینفعان مسأله یکی از جواب های پارتویی به عنوان جواب نهایی مدل انتخاب می شود. مدل پیشنهادی توانایی آن را دارد که در سایر بخش های دانشگاه علوم پزشکی کردستان یا سایر دانشگاه ها مورد استفاده قرار گیرد.