به منظور بررسی امکان تفکیک سریع گونه های تیره Botryosphaeriaceae توسط نشانگر مولکولی rep-PCR 52 جدایه متعلق به 27 گونه از 8 جنس، شناسایی شده توسط مطالعات فیلوژنتیکی، انتخاب و مورد بررسی قرار گرفتند. اثر انگشت ژنومی جدایه ها با استفاده از تکنیک rep-PCR و آغازگرهای REP، ERIC و BOX تعیین شد. آنالیز خوشه ای الگوهای باندی نشان داد که از 27 گونه مورد مطالعه 23 گونه توسط هر 3 نوع آغازگر تفکیک می شوند. درحالیکه دو گونه Diplodia sp.1 و Diplodia sp.2 توسط آغازگرهای REP و BOX و Spencermartinsia sp.2 و Sp. viticola نیز توسط آغازگرهای ERIC و BOX از هم تفکیک نشدند. در مجموع نتایج نشان داد که امکان تفکیک تمامی گونه های مورد بررسی در این مطالعه با استفاده از هر 3 نوع آغازگر یا دو آغازگر REP و ERIC وجود دارد. میزان تکرارپذیری این تکنیک در تفکیک اعضای تیره Botryosphaeriaceae در این بررسی بیش از 80% برآورد شد.
