کپک های دوده ای آسکومیست های اپی فیتی هستند که روی سطح اندام های گیاهی رشد می کنند و معمولا واجد هیف های تیره بوده و کلنی های سیاه یا خاکستری رنگ ایجاد می کنند. این قارچ ها اغلب همراه حشرات تولید کننده عسلک به ویژه شپشک ها روی سطح اندام های گیاهان زنده به سر می برند. کلنی های قارچ روی برگ باعث کاهش فتوسنتز شده و میزان دریافت نور را کاهش میدهند. تاکسونومی قارچ های مولد کپک دوده ای بر اساس ویژگی های ریختی به دلایل مختلف دارای ابهام می باشد. در سال های اخیر از روش های مولکولی مبتنی بر توالی DNA در شناسایی این قارچ ها استفاده شده است. در این مطالعه به منظور بررسی تاکسونومی قارچ های مولد کپک دوده ای در شرق استان گیلان، 100 جدایه از شهرستان های مختلف جمع آوری گردید. جدایه ها روی محیط کشت سیب زمینی دکستروز آگار (PDA) کشت و خالص سازی شدند. بعد از استخراج DNA ژنومی، جدایه ها با استفاده از آغازگر (GTG)5 به 18 گروه تفکیک شدند و از هر گروه یک جدایه به عنوان نماینده برای مطالعات فیلوژنتیکی و مورفولوژیکی انتخاب شد. شناسایی مولکولی جدایه ها با استفاده از دو جایگاه هسته ای ITS و RPB2 انجام شد. آنالیزهای فیلوژنتیکی براساس روش های MP با نرم افزار PAUP انجام شد. براساس داده های مولکولی و مورفولوژیکی6 گونه شامل Conidiocarpus sp. 1، Conidiocarpus sp. 2، Polychaeton citri، Capnodium sp. 1، Capnodium sp. 2 و Leptoxyphium sp. در این مطالعه شناسایی شدند.