ارزیابی تنوع ژنتیکی در گونه های گیاهی به ویژه به کمک نشانگرهای مولکولی دارای اهمیت بسیار زیادی در اصلاح گیاهان است زیرا اساس گزینش مطلوب بر پایه وجود تنوع ژنتیکی است. در این مطالعه، ارقام گندم رایج در ایران شامل 38رقم گندم نان (Triticum aestivum)، به همراه سه رقم دوروم (T. durum) و یک رقم تریتیکاله به منظور بررسی تنوع ژنتیکی با استفاده از 27 نشانگر چندشکل ریز ماهواره مورد بررسی قرار گرفتند. در مجموع 117 الل در دامنه 2تا 9 و میانگین 5/4 مشاهده شد.نشانگرهای Xgwm11 و Xgwm473 با دو الل کمترین و Xwmc617 با نه الل بیشترین تعداد الل تکثیر شده را به خود اختصاص دادند. دامنه محتوی چند شکلی این نشانگرها (PIC) از18/0 تا 84/0 متغیر بود. گروه بندی ژنوتیپ ها با استفاده از الگوریتم UPGMA و ضریب تشابه دایس، بیشترین تشابه را با اطلاعات شجره ای در دسترس ژنوتیپ ها داشت. نتایج حاصل از این مطالعه نشان داد که می توان با استفاده از تعداد کمی نشانگرهای ریز ماهواره تنوع موجود در ارقام و توده های خود بارور گندم را به طور مطلوبی مورد بررسی قرار داد.