بهمن بهرام نژاد

یکی از مهمترین پروتئین هایی که در بحث خاموشی ژن و ایجاد مولکو لهایRNAکوچک نقش فعال و بسزایی دارد، پروتئینهای آرگونات هستند که فعالیت برشی اندونکلئولیتیکی برای بسیاری از آنها ثابت شده است. هدف از این تحقیق مطالعه بیوانفورماتیکی پروتئینهای آرگونات موجود در گیاه تو ت فرنگی جنگلی با استفاده از روش های بیوانفورماتیکی است. توالی های نوکلئوتیدی ژ نهای آرگونات گیاه تو ت فرنگی جنگلی با استفاده از توالیهای پروتئین های آرگونات آرابیدوپسیس، بوسیلهBLASTاز پایگاه اطلاعاتی مورد نظر دریافت شد، سپس همردیفیتوالی ها، تصاویر سه بعدی، دامنه ها و درخت فیلوژنی این پروتئی نها مشخص شد و در انتها خصوصیات بیشتری از این پروتئین ها مورد بررسی قرار گرفت. این تحقیق نشان داد که توت فرنگی جنگلی دارای 13 پروتئین آرگونات می باشد. این پروتئین ها در سه دسته مجزا قرار می گیرند. طول آنها بین 845 اسید آمینه تا 1956 اسیدآمینه متغیر بود. میانگین طول همه پروتئی نهای آرگونات در تو تفرنگی جنگلی 1076 اسیدآمینه است و میانگین وزن آن ها در PIWI و MID ،PAZ توت فرنگی جنگلی 120 کیلو داالتون است. این پروتئینها دارای سه دامنه اصلی به نا مهای به صورت حفظ شده م یباشند که پروتئین آرگونات شماره 6 توت فرنگی جنگلی علاوه بر سه دامن ه اصلی ذکر شده را دارد. وجود این دامنه در پروتئی نهای آرگونات یک گیاه برای GT1-Sucrose-synthase دامنه دیگری به نام اولین بار گزارش می شود و تا به حال در سایر گیاهان و جانوران گزارش نشده است.. نتایج این تحقیق نشان داد که پروتئین های آرگونات توت فرنگی جنگلی مانند آرگونات های آرابیدوپسیس در سه گروه مجزا قرار م یگیرند که این موضوع نشاندهنده حفظ شدگی پروتئین های آرگونات در گیاهان متفاوت م یباشد. واژههای کلیدی