پروتئین های آرگونات از پروتئین های دخیل در بحث خاموشی ژن هستند که فعالیت اندونکلئولیتیکی برای بسیاری از آنها به اثبات رسیده است. شناسایی و بررسی این پروتئینها در گیاهان مختلف میتواند کمک شایانی برای انجام پروژه های مهندسی ژنتیک در گیاهان مختلف باشد. هدف از این تحقیق شناسایی و بررسی پروتئین های آرگونات موجود در ژنوم 6 گیاه دارویی با استفاده از ابزارها و روش های بیوانفورماتیکی است. توالی های اسید آمینه پروتئین های آرگونات گیاهان مورد بررسی با استفاده از توالی های پروتئین های آرگونات آرابیدوپسیس، از پایگاه اطلاعاتی فیتوزوم دریافت شد، سپس همردیفی توالی ها ، ساختار سه بعدی، دومین ها و درخت فیلوژنی این پروتئین ها مشخص شد. این تحقیق نشان داد که گیاهان دارویی مورد بررسی دارای 6 تا 18 ژن کد کننده پروتئین آرگونات در ژنوم خود هستند. پروتئین های آرگونات موجود در این گیاهان به طور کلی می باشند، این پروتئین ها هنگام رسم درخت فیلوژنی در PIWI و MID،PAZ دارای سه دومین اصلی به نام های سه دسته مجزا قرار می گیرند که نشان از حفظ شدگی بالای آنها است. طول این پروتئین ها در گیاهان مورد بررسی بین 846 اسید امینه تا 1187 اسیدامینه می باشد که میانگین طول و وزن این پروتئین ها در این گیاهان به ترتیب 970 اسیدامینه و 108 کیلو داالتون است. به طور کلی نتایج این تحقیق نشان داد که پروتئین های آرگونات گیاهان دارویی مورد بررسی ویژگیهای کلی پروتئین های آرگونات را دارند و تفاوت بین این پروتئینها بیشتر در تعداد و خصوصیات فیزیکی آنها است.
