ژن 1-دئوکسی-دی-زایلوز 5-فسفات سنتاز یک ژن کلیدی در مسیر بیوسنتزی ایزوپرنوئیدها می باشد که این ژن در MEP با استفاده از پیروات و گلیسر آلدهید3-فسفات باعث تولید 1-دئوکسی-دی-زایلوز 5-فسفات می گردد. با توجه به اهمیت بالای ایزوپرنویید ها بررسی و شناخت بیشتر این متابولیت ها حائز اهمیت می باشد. هدف از این تحقیق مطالعه بیوانفورماتیکی توالی نوکلوتیدی مربوط به ژن مزبور و طراحی آغازگر به منظور جداسازی این ژن در گیاه پیرتروم Chrysanthemum cinerariaefoliumاز خانواده گل ستاره ایها می باشد. در این تحقیق ابتدا توالی های نوکلوتیدی آنزیم 1-دئوکسی-دی-زایلوز 5-فسفاتسنتاز از پایگاه اطلاعاتی NCBI دریافت شد و سپس توالی های گرفته شده توسط نرم افزار تحت وب ClustalW همردیف شدند و درخت فیلوژنی آن توسط نرم افزار MEGA4رسم و مورد بررسی قرار گرفت . از همردیف سازی توالی های بدست آمده برای همین توالی در گیاه C.cinerariaefolium آغازگرهای ویژه مستقیم و معکوس طراحی و ساخته شد. نتایج واکنش ژنجیره ای پلیمراز و مشاهده باند با طول bp 715 نشان داد که آغازگرهای اختصاصی طراحی شده برای جداسازی ژن DXS کارایی لازم را دارند.
