برآورد تنوع ژنتیکی دارای اهمیت است زیرا کاهش تنوع ژنتیکی ممکن است موجب آسیب پذیری شدید محصولات زراعی در برابر تنشهای محیطی آفات و بیماریها و در نتیجه کاهش عملکرد شود. اولین گام در زمینه اصلاح گندم سرداری دسترسی به منابع ژنتیکی آن و بررسی تنوع ژنتیکی موجود می باشد ولی تاکنون اطلاعات موجود در گندم سرداری از طریق بررسی های مورفولوژیکی که متاثر از محیط هستند و نمی توانند نماینده کامل ژنوم باشند به دست آمده است. لذا به نظر می رسد استفاده از نشانگرهای DNA که چند شکلی را در سطح DNA آشکار می کنند کاراتر باشد.
