ساختار میکروسکوپی ذرات پرلیت به گونه ای است که با داشتن حفرات و تخلخل های چند لایه قادر است حتی در حالت اشباع از آب نیز حداقل بیست درصد از تخلخل مفید خود را در خاک حفظ کرده و از این طریق تبادل هوا و اکسیژن را نیز در محیط کشت افزایش می دهد؛ لذا مزایای استفاده از آن در کشاورزی شامل این موارد خواهد بود: اصلاح سیستم هوادهی و آبدهی خاک، قدرت نگهداری آب و مواد غذایی در خود و تغذیه مداوم گیاه، PH خنثی (5/7-5/6) و عدم اختلال در رشد طبیعی گیاه، عدم ایجاد تغییر ناگهانی در دمای خاک، استریل بودن از نظر بهداشتی و جلوگیری از اثرات منفی علف های هرز و آفات گیاهی و بهبود عمل تهویه ی خاک و پخش یکسان آب در خاک. علاوه بر این، از پرلیت می-توان به تنهایی در ترکیب با کود های آلی استفاده کرد و با توجه به اینکه پرلیت یک شیشه انبساط یافته است، بنابراین بر خلاف مواد آلی پوسیده نخواهد شد و خواص ثابت خود را برای مدت طولانی در خاک حفظ خواهد کرد