1403/02/15
امیر رشیدی

امیر رشیدی

مرتبه علمی: استاد
ارکید:
تحصیلات: دکترای تخصصی
اسکاپوس: 23009961900
دانشکده: دانشکده کشاورزی
نشانی: سنندج- دانشگاه کردستان- دانشکده کشاورزی - گروه علوم دامی
تلفن: 08733668512

مشخصات پژوهش

عنوان
مقایسه روش های Bayes A ،GBLUP و Bayes B با استفاده از صحت پیش بینی ارزش های اصلاحی ژنومی
نوع پژوهش
مقاله ارائه شده کنفرانسی
کلیدواژه‌ها
انتخاب ژنومی، روش های بیزی، شبیه سازی ژنومی، صحت، وراثت پذیری
سال 1397
پژوهشگران زانیار مرادی ، محمد رزم کبیر ، رستم عبداللهی آرپناهی ، امیر رشیدی

چکیده

هدف از این پژوهش مقایسه صحت ارزش اصلاحی ژنومی با استفاده از روش های آماری مختلف در سطوح متفاوت وراثت پذیری و تعداد QTL بود. به این منظور ژنومی متشکل از 10 کروموزوم هر یک به طول 100 سانتی مورگان با تراکم نشانگری 50k شبیه سازی شد. به منظور مقایسه صحت ارزش های اصلاحی ژنومی 4 سناریو (سناریو 1: وراثت پذیری 0/5 تعداد QTL 50، سناریو 2: وراثت پذیری 0/5 تعداد QTL 500، سناریو 3: وراثت پذیری 0/1 تعداد QTL 50 و سناریو 4: وراثت پذیری 0/1 تعداد QTL 500) در نظر گرفته شد. در ابتدا جمعیت پایه ای با اندازه 1000حیوان (500نر و 500ماده) ایجاد گردید که تا 1000 نسل طی آمیزش تصادفی اندازه جمعیت ثابت و از نسل 1000 تا 1005 بصورت تدریجی به 500 حیوان کاهش یافته و در نسل 1010 به 2000 حیوان افزایش یافت. از آخرین نسل جمعیت پایه پنج نسل شبیه سازی شد که 2 نسل به عنوان جمعیت مرجع و 3 نسل به عنوان جمعیت تأیید در نظر گرفته شد. در همه روش ها با افزایش سطح وراثت پذیری صحت افزایش یافت. در وراثت پذیری 0/5 با افزایش تعداد QTL برای روش های بیزی A و بیزی B صحت کاهش، اما برای روش GBLUP صحت افزایش یافت همچنین در وراثت پذیری 0/1 با افزایش تعداد QTL برای همه روش ها صحت افزایش یافت. در همه سناریوها با افزایش فاصله نسل بین جمعیت مرجع و جمعیت تأیید صحت ارزش های اصلاحی ژنومی کاهش یافت به جز سناریو سوم که کاهش قابل توجهی در نسل دوم نسبت به نسل سوم مشاهده شد.